宏蛋白組學是應用蛋白質組學技術對微生物群落進行研究的一項新技術,在特定的時間對微生物群落的所有蛋白質的組成進行大規模的鑒定。宏蛋白組能夠提供微生物在生態系統中的功能信息,它有望把微生物群落的遺傳和功能多樣性聯系起來,對于不同環境的宏蛋白組分析可以捕捉新的功能基因和代謝途徑、鑒定與特異性脅迫有關的蛋白,蛋白組學聯合宏基因組學數據可以更好的揭示環境群落分類多樣性、功能多樣性和生物過程。
分析方法
將非標定量技術、高效液相色譜分級技術以及基于質譜的定量蛋白質組 學技術等一系列前沿技術的有機結合,對樣本進行定量宏蛋白質組學的研究。為了分析樣本中的物種組成信息,我們使用Unipept軟件預測肽段對應物種的分類(taxonomy)信息,物種相對豐度值為樣本中所有比對到該物種的peptides intensity總和占所有peptides intensity總和的比例。然后使用Krona 軟件對物種注釋結果進行動態可視化展示。
詳情請聯系技術經理。
物種相對豐度柱狀圖
宏蛋白組分析