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蛋白質功能富集分析

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蛋白質功能富集分析

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     高通量蛋白質組學分析往往會得到大量差異表達蛋白,簡單的統計很難將這些差異蛋白與某個待研究的生物學現象及其潛在機制聯系起來。功能富集分析可以幫助我們快速從龐雜的組學數據中發掘規律,期望發現在生物學過程中起關鍵作用的生物通路,從而揭示和理解生物學過程的基本分子機制。

方法

      富集分析采用 Fisher 精確檢驗方法檢測待測功能集在差異蛋白中是否顯著富集。這些功能集可以是 Gene Ontology 功能、KEGG 通路、蛋白結構域、Complex(復合體)等。富集分析結果通常用富集程度(fold enrichment),富集顯著性(p value)兩個特征來描述差異蛋白在指定功能集中的富集情況,當 p value < 0.05 時認為富集是具有統計學意義的

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