菌種鑒定的重要依據有哪些?常用的菌種鑒定方法介紹
16srDNA是細菌染色體上編碼16srRNA相對應的DNA序列,存在于所有細菌染色體基因中。16srDNA (16SrRNA為核糖體的RNA的一個亞基,16srDNA就是編碼該亞基的基因)鑒定是指用利用細菌16srDNA序列測序的方法對細菌進行種屬鑒定。rRNA指的是rDNA的轉錄產物,它是構成核糖體的重要成分,核糖體由許多小的rRNA分子組裝而成,16S rRNA是其中一個組件,一般所分析的對象都是16s rDNA,因為DNA提取容易,也比較穩定。細菌的16S rDNA序列在不同的物種間是高度保守的,不同的物種間序列是不一樣的,因而對此序列通過PCR擴增、測序,與GenBank中的已知序列進行比對后,則可判定細菌種類,將其劃分到屬或種。
1、基因組DNA樣本濃度至少大于50ng/μl,體積不少于10μl
2、菌液樣本:500ul菌液
3、鑒定只接收純化后的單一菌種,不接受具有致病性的樣品
4、實驗樣品不純造成的測序套峰,我們將收取全額的實驗費用
菌落形態
16S rDNA PCR 擴增電泳圖
基于 16S rDNA 序列構建的沙門氏菌種群鄰接法系統進化樹
菌種鑒定