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蛋白泛素化修飾（Ubiquitination）

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蛋白泛素化修飾（Ubiquitination）

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項目介紹

     蛋白泛素化修飾（Ubiquitination）常伴隨泛素-蛋白酶體降解，引起蛋白穩定性變化，參與增殖凋亡、內吞、免疫等各種生物調控過程。其發生過程是通過一個三酶級聯 (E1-E2-E3)反應，使得單或多個泛素分子連接到蛋白氨基酸（Lys）側鏈上，并常伴隨蛋白酶體降解，調控蛋白表達水平變化。發生泛素化修飾的賴氨酸共價連接泛素分子，即兩個甘氨酸K-ε-GG殘基，使分子量產生114.1 Da的質量偏移。利用質譜可準確測定分子量是否發生114.1Da的質量偏移，從而檢測泛素化修飾肽段及位點。 4D-label free泛素化蛋白組學是基于timsTOF Pro質譜儀，通過數據依賴性采集-同步累積連續碎裂（ddaPASEF）掃描模式進行泛素化差異蛋白質組學分析。4D-label free修飾組，利用了離子淌度分離，能根據分子的形狀、截面積屬性，可有效區分修飾同分異構多肽，極大提高修飾的鑒定深度，以更少上樣量、更快掃描速度，實現蛋白質組學在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

技術路線

技術優勢

1. 4D技術加持，提高定量的準確性、鑒定深度，更加適合微量樣本；

2. 克服標記定量蛋白質組學技術在樣本數量上的限制，靈活方便；

3. 基于質譜平臺（Bruker timsTOF pro），檢測速度提升近一倍；

4. 經驗豐富——超18年蛋白平臺服務經驗，擁有豐富的高水平項目文章；

5. 數據保證——采用進口金標抗體，數據結果穩定可靠；

6. 系統解決方案——提供修飾組學至驗證、上下游聯合分析，實現快捷”一站式”服務。

數據分析

1、標準數據分析內容

鑒定分析：鑒定與定量結果統計;單個樣本蛋白質鑒定結果統計;韋恩圖。

表達差異分析：差異結果統計;差異結果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖。

多組的比較分析(組別>=3)：mufzz聚類;雷達圖;箱線圖。

功能分析：亞細胞定位;結構域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網絡分析。

質量控制分析：肽段離子質量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質豐度比分布。

2、高級數據分析

功能分析：GSEA富集分析。

臨床藥物研究：藥物靶點注釋。

標志物篩選：集成機器學習。

與臨床表征的聯合分析：熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析。

推薦組合產品

蛋白表達水平全面解析：轉錄組+蛋白組+泛素化組。

推薦應用領域

1. 植物發育與抗逆；

2. 感染與免疫研究；

3. 衰老再生及退行性疾病。


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蛋白泛素化修飾（Ubiquitination）

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