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蛋白甲基化修飾（Methylation）

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蛋白甲基化修飾（Methylation）

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項目介紹

     蛋白甲基化（Methylation）能修飾組蛋白、轉錄因子等蛋白，參與基因表達調控、相互作用等多種過程中，其發生過程是在甲基酶的作用下將甲基轉移到蛋白質的特定氨基酸殘基上。蛋白質的甲基化通常發生在精氨酸和賴氨酸上，可同時連接最多3個甲基基團，其單/雙/三甲基化的分子量會相應增加14.02 Da/28.03 Da/42.05 Da。質譜可準確測定這些分子量的變化，檢測甲基化修飾肽段及位點的分析。 4D-label free甲基化修飾蛋白組學是基于timsTOF Pro質譜儀，通過數據依賴性采集-同步累積連續碎裂（ddaPASEF）掃描模式進行甲基化差異蛋白質組學分析。4D-label free修飾組，利用了離子淌度分離，能根據分子的形狀、截面積屬性，可有效區分修飾同分異構多肽，極大提高修飾的鑒定深度，以更少上樣量、更快掃描速度，實現蛋白質組學在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

技術路線

     蛋白質甲基化通常發生在精氨酸和賴氨酸上，可同時連接最多3個甲基基團，其單/雙/三甲基化的分子量會相應增加14.02 Da/28.03 Da/42.05 Da。質譜可精確測定這些分子量的變化，檢測甲基化修飾肽段及位點的分析。

技術優勢

1. 4D技術加持，提高定量的準確性、鑒定深度，更加適合微量樣本；

2. 克服標記定量蛋白質組學技術在樣本數量上的限制，靈活方便；

3. 技術平臺——基于代質譜平臺（Bruker timsTOF pro），檢測速度提升近一倍；

4. 經驗豐富——超16年蛋白平臺服務經驗，擁有豐富的高水平項目文章；

5. 數據保證——采用進口金標抗體，數據結果穩定可靠；

6. 系統解決方案——提供修飾組學至驗證、上下游聯合分析，實現快捷”一站式”服務。

數據分析

1、標準數據分析內容

鑒定分析：鑒定與定量結果統計;單個樣本蛋白質鑒定結果統計;韋恩圖。

表達差異分析：差異結果統計;差異結果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖。

多組的比較分析(組別>=3)：mufzz聚類;雷達圖;箱線圖。

功能分析：亞細胞定位;結構域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網絡分析。

質量控制分析：肽段離子質量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質豐度比分布。

2、高級數據分析

功能分析：GSEA富集分析。

臨床藥物研究：藥物靶點注釋。

標志物篩選：集成機器學習。

與臨床表征的聯合分析：熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析。

推薦應用領域

1. 染色質結構以及轉錄調控；

2. 穩定蛋白質，調控蛋白轉錄以及結合活性、DNA復制和損傷；

3. 癌癥、衰老、老年癡呆等許多疾病密切相關，是表觀遺傳學的重要研究內容。


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