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項目介紹

不同類型的蛋白翻譯后修飾在生物過程中有著不同的調(diào)控作用，不同功能特性的蛋白在生物進化過程中有著不同程度的序列保守性，例如直系同源基因相關(guān)的蛋白在進化上處于高度保守狀態(tài)。發(fā)生在蛋白序列進化高度保守區(qū)域上的翻譯后修飾有可能預示著在生物過程中起關(guān)鍵的調(diào)控作用。

分析方法

使用 BLAST 方法對給定物種的蛋白序列進行同源比對分析，通過適當?shù)倪^濾條件篩選出直系同源蛋白，然后采用 MUSCLE 軟件對找到的同源蛋白進行多序列比對。根據(jù)多序列比對結(jié)果，統(tǒng)計在本研究中發(fā)生修飾的氨基酸在其同源蛋白中保守的比例（如果修飾位點氨基酸在其同源蛋白中為其他氨基酸或缺失，定義為“不保守位點”；反之為“保守位點”）。比較特定氨基酸上發(fā)生修飾的保守比例與未發(fā)生修飾的保守比例，采用 Fisher 精確檢驗計算保守性 p value。

樣品要求

詳情請聯(lián)系技術(shù)經(jīng)理。

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