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PSEA分析

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項目介紹

PSEA（Protein Set Enrichment Analysis）與傳統(tǒng)的富集分析不同，傳統(tǒng)的富集分析更加依賴差異蛋白，這涉及到差異閾值的設定，存在一定主觀性并且只能用于顯著差異的蛋白富集。而PSEA則不局限于差異蛋白，從蛋白集的富集角度出發(fā)，理論上更容易囊括細微但協(xié)調(diào)性的變化對生物通路的影響，故能兼顧差異較小的蛋白尤其是差異倍數(shù)不太大的蛋白集。可選的富集功能為 Gene Ontology功能，KEGG通路。

分析方法

使用GSEA軟件對所有蛋白在比較組中表達量的變化 Ratio 值進行排序，排序之后的蛋白列表頂部可以看作是上調(diào)蛋白，底部是下調(diào)蛋白。PSEA分析的是一個功能集下的所有蛋白在這個排序列表的頂部或者底部富集，如果在頂部富集，該功能集是上調(diào)趨勢；反之，如果在底部富集，則是下調(diào)趨勢。

樣品要求

詳情請聯(lián)系技術經(jīng)理。

項目案例