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生物標志物預測分析

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生物標志物預測分析

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項目介紹

     癌癥相關的生物標志物是表明腫瘤狀態、進展特征和對相關治療產生反應的生物功能分子(基因、蛋白質或小分子物質)。已發現的癌癥相關生物標志物大多是轉錄因子,細胞表面受體或其他組織細胞響應癌癥細胞而產生的分泌蛋白。針對蛋白質組學中的大規模質譜樣本或臨床樣本,獲取在不同樣本類別間(二類別或者多類別)表達量具有顯著差異的一組蛋白或基因,作為篩選得到的潛在候選生物標志物。適用范圍:

1、二分類或多類別樣本,每個類別內的樣本不少于 40 個。

2、對于二分類樣本,要求數量較多樣本與數量較少樣本的數量比例應小于 2:1;對于多類別樣本,要求數量最多樣本與數量最少樣本的數量比例應小于 2:1。

分析方法

      本分析流程主要基于 Scikit-learn 機器學習函數庫,包括特征排序、模型構建、模型評估和結果可視化展示等分析模塊。可以基于已有結構化數據得到全局最優模型、局部最優模型、候選生物標志物及可視化結果。

樣品要求

詳情請聯系技術經理。

項目案例

篩選得到特征蛋白打分柱狀圖

篩選得到特征蛋白打分柱狀圖

全局最優模型在訓練集和測試集上的ROC曲線

高排序蛋白在不同類別樣本中的表達量箱型圖

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