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染色質(zhì)構(gòu)象捕獲（Hi-C）

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染色質(zhì)構(gòu)象捕獲（Hi-C）

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項(xiàng)目介紹

Hi-C技術(shù)源于染色體構(gòu)象捕獲 （Chromosome conformation capture, 3C）技術(shù)，以整個(gè)細(xì)胞核為研究對(duì)象，利用高通量測(cè)序技術(shù)，結(jié)合生物信息分析方法，研究全基因組范圍內(nèi)整個(gè)染色質(zhì)DNA在空間位置上的關(guān)系，通過(guò)對(duì)染色質(zhì)內(nèi)全部DNA相互作用模式進(jìn)行捕獲，獲得高分辨率的染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)信息。

技術(shù)特點(diǎn)：

 1. 研究全基因組范圍內(nèi)整個(gè)染色質(zhì)DNA在空間位置上的關(guān)系

 2. 基因組組裝組裝水平提升到染色體水平。

 3. 無(wú)需群體，單個(gè)個(gè)體就能實(shí)現(xiàn)染色體定位，周期短，成本低

 4. 相對(duì)遺傳圖譜，標(biāo)記密度更大，序列定位更完整

實(shí)驗(yàn)流程：

分析流程：

標(biāo)準(zhǔn)分析

（1） 數(shù)據(jù)過(guò)濾及比對(duì)

（2） ChIP分布趨勢(shì)分析

高級(jí)分析

（3） 染色體互作分析

（4） 與ChIP聯(lián)合分析

（5） 轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析

（6） 染色體三維結(jié)構(gòu)模型構(gòu)建

樣品要求

細(xì)胞數(shù)：≥1ⅹ107     交聯(lián)固定后干冰運(yùn)輸

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染色質(zhì)構(gòu)象捕獲（Hi-C）

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