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    長鏈非編碼RNA(lncRNA)

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    長鏈非編碼RNA(lncRNA)

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    項目介紹

    長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類轉錄本長度超過200 nt的RNA分子,它們不編碼蛋白。lncRNA的表達受到發育調控,是組織和細胞特異的。相當一部分lncRNA只位于細胞核內。它們包含許多類型的轉錄本,在結構上類似mRNA,有時也轉錄成編碼基因的反義轉錄本。lncRNA被認為執行了重要的調控功能,也與疾病發展息息相關。

    技術特點

     1. lncRNA在不同的發育階段lncRNA的表達水平不同

     2. 在不同的癌組織或其他疾病中,lncRNA差異性表達

     3. LncRNA的調控機制多元化、復雜性高,在細胞中存在數量是mRNA的3~100倍

    技術流程

    圖中深色為該技術流程

    分析流程:

    標準分析

    (1) 數據過濾及比對分析

    (2) 轉錄本拼接

    高級分析

    (3) LncRNA的篩選及分析

    (4) 靶基因預測

    (5) 差異基因GO/KEGG分析,推測突變基因富集在哪些代謝通路。

    樣品要求

    樣本要求:

    RNA濃度≥20ng/ul 總量≥2ug    

    細胞數≥5X106

    項目案例

    差異分析聚類圖

    靶基預測圖

    長鏈非編碼RNA(lncRNA)

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