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    SmallRNA

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    SmallRNA

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    項目介紹

    Small RNA是一大類調(diào)控分子,幾乎存在于所有的生物體中。Small RNA包括:microRNA、ncRNA、siRNA、snoRNA、piRNA、rasiRNA等等。Small RNA通過多種多樣的作用途徑,包括mRNA降解、翻譯抑制、異染色質(zhì)形成以及DNA去除,來調(diào)控生物體的生長發(fā)育和疾病發(fā)生。Small RNA轉錄組測序是鑒定和定量解析small RNA的新方法和有力工具。

    技術特點

    1.可以直接從核苷酸水平上研究Small RNA分子,不存在傳統(tǒng)芯片雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應和背景噪音問題,非常利于區(qū)分相同家族以及序列極為相似的不同Small RNA分子;

    2.可以對任意物種進行高通量分析,無需任何預先的序列信息以及二級結構信息。

    3.靈敏度高,測序通量大,為Small RNA分子的發(fā)現(xiàn)和研究提供了極大的數(shù)據(jù)深度與覆蓋率,能夠檢測豐度極低的稀有轉錄;

          4.測序產(chǎn)生的原始數(shù)據(jù)可以與多種分析軟件兼容,可以注釋Small RNA的基因組信息,并分析其表達水平,能夠隨時使用公用Small RNA數(shù)據(jù)庫注釋已知的Small RNA,還可以進一步分析  未匹配的數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)新的Small RNA種類及異構體,尋找更深入的研究信息。

    實驗流程

    圖中深色為該實驗流程

    分析流程

    標準分析

    (1) 數(shù)據(jù)過濾及比對

    (2) MicroRNA的比對分析及預測

    高級分析

    (3) MicroRNA表達水平分析

    (4)MicroRNA表達差異性分析


    樣品要求

    送樣要求

    RNA濃度≥200ng/ul,總量≥2ug

    細胞數(shù)≥5ⅹ106

    項目案例

    對68個標本的聚類分析

    亞型差異表達維恩圖分析

    差異表達基因熱圖分析

    SmallRNA

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