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TMT修飾組

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TMT修飾組

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項目介紹

     TMT是一種基于等重同位素的標記定量蛋白組學技術,而TMT修飾組是將TMT與磷酸化/乙酰化修飾結合的翻譯后修飾組學。它借助于TMT標記、分級的優勢達到了在保證樣本間重復穩定性的同時實現更高檢測深度的優勢。

技術路線

技術優勢

1. 同一批次標記定量穩定性高。

2. 通過分級方法可大大增加修飾位點的鑒定深度。

數據分析

1、標準數據分析內容

鑒定分析:鑒定與定量結果統計;單個樣本蛋白質鑒定結果統計;韋恩圖。

表達差異分析:差異結果統計;差異結果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖。

多組的比較分析(組別>=3):mufzz聚類;雷達圖;箱線圖。

功能分析:亞細胞定位;結構域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網絡分析。

質量控制分析:肽段離子質量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質豐度比分布。

2、高級數據分析

功能分析:GSEA富集分析。

臨床藥物研究:藥物靶點注釋。

標志物篩選:集成機器學習。

與臨床表征的聯合分析:熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析。

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