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N-糖基化蛋白質組學

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項目介紹

N糖基化是指蛋白質在酶的作用下將糖鏈連接到蛋白質特定氨基酸形成糖苷鍵的過程。細胞內超過 50% 的蛋白質都有一個或多個糖鏈。連接于天冬酰胺（Asn）殘基上的N-糖基化在真核生物中廣為存在，也是研究最為深入的一種糖基化形式。蛋白質N-糖基化修飾主要在復雜的多細胞或組織形成過程中起關鍵作用，參與細胞識別、免疫應答、細胞分化等生命活動。蛋白質經酶解后利用凝集素（lectin）富集N-糖基化肽段，再用N-糖酰胺酶（PNGase）在重水中切除糖鏈，然后通過LC-MS/MS對糖基化位點進行分析，實現大規模N-糖基化蛋白質定性定量分析。

技術路線

數據分析

1、標準數據分析內容

鑒定分析：鑒定與定量結果統計;單個樣本蛋白質鑒定結果統計;韋恩圖。

表達差異分析：差異結果統計;差異結果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖。

多組的比較分析(組別>=3)：mufzz聚類;雷達圖;箱線圖。

功能分析：亞細胞定位;結構域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網絡分析。

質量控制分析：肽段離子質量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質豐度比分布。

2、高級數據分析

功能分析：GSEA富集分析。

臨床藥物研究：藥物靶點注釋。

標志物篩選：集成機器學習。

與臨床表征的聯合分析：熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析。

推薦應用領域

1. 信號轉導研究；

2. 基因表達調控研究；

3. 腫瘤發展機制研究。

樣品要求

樣品類型		送樣量
動物組織類	常規動物組織（心、肝、脾、肺、腎、肌肉等）	30mg-1g
植物組織類	柔軟組織（葉、花、藻類、大型真菌等）	100mg-1g
微生物類	菌類	50mg-2g
細胞樣品	懸浮細胞、貼壁細胞	1.5-5×107