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微量蛋白質組

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微量蛋白質組

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項目介紹

     目前,基于質譜的蛋白質組學方法能夠實現對蛋白質的定性和定量,以及復雜樣本中的翻譯后修飾測定,但是,常規的蛋白質組學需要大量樣本,比如細胞需要5×106,組織需要30mg。對于一些特殊的樣本類型,比如流式分選的細胞、原代培養細胞,以及一些臨床穿刺組織、玻璃體、房水等,這些樣品類型珍貴、不易獲取、樣本量少,往往達不到常規蛋白質組學對于樣本量的要求。微量蛋白質組細胞用量低至200個,輕松實現微量樣本的檢測自由。

微量蛋白質組

1)主流富集方法+革命性質譜策略,實現微量、珍稀樣本的蛋白質檢測

2)磁珠無偏好富集蛋白組分,去除高豐度干擾,突破蛋白檢測深度

3)4D-DIA四維全息掃描,高穩定性,高重復性,適合大隊列樣品分析

適用樣品類型

微量蛋白質組有效解決了部分老師樣本量少、樣本珍稀、難獲得等問題,并且也適用于一些特殊樣品類型,比如臨床穿刺組織、腦脊液、原代細胞、微量血液等。

主流富集方法+革命性質譜策略

(1)SP3技術

蛋白質組學分析的關鍵步驟是蛋白質的提取和前處理過程,以保證下游檢測的靈敏度。SP3(single-pot solid-phase-enhanced sample preparation)是主流的樣品處理技術之一,可對蛋白質實現無偏倚和幾乎無損的處理,其原理是利用磁珠表面攜帶的羧基基團在高濃度有機溶劑的驅動下與蛋白結合,磁珠上的蛋白在水溶液中被胰蛋白酶酶解。酶解后的蛋白可在水溶液條件下洗脫,洗脫下的蛋白/肽段可進行質譜分析,主要操作流程見下圖。所有步驟在一個管中即可完成,設備和流程簡單,用時短,速度快,效率高。

2)4D-DIA技術

微量蛋白質組將DIA與PASFE技術相結合,基于全新一代timsTOF Pro2質譜平臺,實現近乎100%的離子利用率,提高低豐度肽段的譜圖質量,同時靈敏度、掃描速度、分離能力全面提升,既能滿足鑒定深度又能兼顧穩定性,尤適用于大隊列樣品的分析。


樣品要求

送樣前請聯系技術經理具體溝通。

項目案例

肺腺癌FFPE組織中腫瘤生長模式的蛋白質組分析

超靈敏蛋白質組學在患者蛋白尿患者腎小球組織上的應用

新生軸突蛋白質組的快速表征

蛋白質組表達的動態范圍,新蛋白質的發現和氨基酸序列覆蓋

學術文章

微量蛋白質組

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