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    高分辨空間代謝組

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    高分辨空間代謝組

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    項目介紹

    MeDIP-Seq（Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing ）采用甲基化DNA免疫共沉淀技術，通過5'-甲基胞嘧啶抗體特異性富集基因組上發生甲基化的DNA片段并進行高通量測序。研究者通過MeDIP Sequencing可以快速有效地尋找基因組上的甲基化區域，從而比較不同樣本間DNA甲基化修飾模式的差異。此方法可以覆蓋整個基因組范圍的甲基化區域并且成本較低，特別適用于多樣品的全基因組DNA表觀遺傳研究。

    技術特點

    1、檢測疾病樣本中DNA甲基化信號富集區域并推斷樣本中表達被 抑制的候選基因集合。

    2、檢測疾病發生發展不同時期，病灶部位的DNA甲基化動態圖譜，篩選表觀遺傳標志幫助界定疾病發展程度。

    3、比較疾病樣本和正常樣本中DNA甲基化區域的信號和位置分布的差異，篩選疾病特異性DNA甲基化區域，觀察這些區域周圍的基因，縮小疾病相關候選基因范圍。

    實驗流程

    分析流程

    標準分析

    （1） 數據過濾及比對

    （2） MeDIP分布趨勢分析

    高級分析

    （3） MeDIP富集peak信息

    （4） 基于peak的多樣品間差異分析

    樣品要求

    樣本要求：

    DNA濃度≥10ng/ul ，總量≥2ug    

    細胞數≥1ⅹ107

    項目案例

    高分辨空間代謝組

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