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項目介紹

MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing )采用甲基化DNA免疫共沉淀技術,通過5'-甲基胞嘧啶抗體特異性富集基因組上發生甲基化的DNA片段并進行高通量測序。研究者通過MeDIP Sequencing可以快速有效地尋找基因組上的甲基化區域,從而比較不同樣本間DNA甲基化修飾模式的差異。此方法可以覆蓋整個基因組范圍的甲基化區域并且成本較低,特別適用于多樣品的全基因組DNA表觀遺傳研究。

技術特點

1、檢測疾病樣本中DNA甲基化信號富集區域并推斷樣本中表達被 抑制的候選基因集合。

2、檢測疾病發生發展不同時期,病灶部位的DNA甲基化動態圖譜,篩選表觀遺傳標志幫助界定疾病發展程度。

3、比較疾病樣本和正常樣本中DNA甲基化區域的信號和位置分布的差異,篩選疾病特異性DNA甲基化區域,觀察這些區域周圍的基因,縮小疾病相關候選基因范圍。

實驗流程

分析流程

標準分析

(1) 數據過濾及比對

(2) MeDIP分布趨勢分析

高級分析

(3) MeDIP富集peak信息

(4) 基于peak的多樣品間差異分析

樣品要求

樣本要求:

DNA濃度≥10ng/ul ,總量≥2ug    

細胞數≥1ⅹ107

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